Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b1Q99NB9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sf3b1Q99NB9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sf3b1Q99NB9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sf3b1Q99NB9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sf3b1Q99NB9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sf3b1Q99NB9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sf3b1Q99NB9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms