Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pcgf6Q99NA9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcgf6Q99NA9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcgf6Q99NA9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms