Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6cQ99N08 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6cQ99N08 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms