Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Usp26Q99MX1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Usp26Q99MX1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Usp26Q99MX1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Usp26Q99MX1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Usp26Q99MX1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Usp26Q99MX1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp26Q99MX1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp26Q99MX1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms