Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rnf17Q99MV7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf17Q99MV7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf17Q99MV7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms