Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nus1Q99LJ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nus1Q99LJ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nus1Q99LJ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nus1Q99LJ8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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