Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cstf3Q99LI7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms