Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp5lQ99LH9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp5lQ99LH9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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