Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nmd3Q99L48 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms