Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pagr1aQ99L02 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pagr1aQ99L02 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms