Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prpf19Q99KP6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms