Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ciao1Q99KN2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ciao1Q99KN2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms