Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrabdQ99JY4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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