Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lims1Q99JW4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lims1Q99JW4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms