Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apobec3Q99J72 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apobec3Q99J72 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms