Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thumpd1Q99J36 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms