Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ9

Prdm9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm9Q96EQ9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm9Q96EQ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm9Q96EQ9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms