Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo1Q924W9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo1Q924W9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms