Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b5Q923D4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b5Q923D4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms