Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prpf3Q922U1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf3Q922U1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms