Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mthfd1Q922D8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mthfd1Q922D8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms