Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf3Q920N1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms