Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med28Q920D3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms