Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cts3Q91ZD5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cts3Q91ZD5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms