Protein–RNA interactions for Protein: Q91YW3

Dnajc3, DnaJ homolog subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc3Q91YW3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dnajc3Q91YW3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnajc3Q91YW3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms