Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atl3Q91YH5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl3Q91YH5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms