Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Setd3Q91WC0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Setd3Q91WC0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms