Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cox4i2Q91W29 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox4i2Q91W29 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms