Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms