Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx18Q8VDS8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx18Q8VDS8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms