Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fyco1Q8VDC1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms