Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg12Q8VDB2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alg12Q8VDB2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms