Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn4Q8VCH8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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