Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Med17Q8VCD5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med17Q8VCD5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms