Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms