Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GcaQ8VC88 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcaQ8VC88 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms