Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ApobrQ8VBT6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApobrQ8VBT6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ApobrQ8VBT6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms