Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top1mtQ8R4U6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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Top1mtQ8R4U6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Top1mtQ8R4U6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top1mtQ8R4U6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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