Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup35Q8R4R6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup35Q8R4R6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms