Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim29Q8R2Q0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim29Q8R2Q0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms