Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Hecw1Q8K4P8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hecw1Q8K4P8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms