Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssh3Q8K330 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssh3Q8K330 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms