Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nsl1Q8K305 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nsl1Q8K305 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nsl1Q8K305 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nsl1Q8K305 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nsl1Q8K305 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nsl1Q8K305 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nsl1Q8K305 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nsl1Q8K305 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nsl1Q8K305 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nsl1Q8K305 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nsl1Q8K305 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms