Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf39Q8K2Z2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms