Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc12Q8K2L8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms