Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf3Q8K268 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf3Q8K268 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms