Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prkd3Q8K1Y2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prkd3Q8K1Y2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms