Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms