Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700001C19RikQ8K168 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms