Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnppd1Q8K158 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnppd1Q8K158 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnppd1Q8K158 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnppd1Q8K158 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnppd1Q8K158 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnppd1Q8K158 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnppd1Q8K158 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cnppd1Q8K158 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cnppd1Q8K158 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Cnppd1Q8K158 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Cnppd1Q8K158 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cnppd1Q8K158 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cnppd1Q8K158 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cnppd1Q8K158 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cnppd1Q8K158 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cnppd1Q8K158 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cnppd1Q8K158 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Cnppd1Q8K158 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnppd1Q8K158 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms